Aktivität und Fortbewegung: Die Erdmaus besitzt mehrere, über den Tag verteilte  Aktivitätsphasen. Die Tiere verlassen ihre Baue sowohl am Tag als auch in der Nacht, wobei die nächtliche Aktivität stärker ausgeprägt ist und besonders die Dämmerung in der Früh und am Abend genutzt wird. Regelmäßige Ruhe- und Aktivitätsphasen bilden sich nur aus, wenn in ihrem Lebensraum reichlich Nahrung vorhanden ist.

Territoriales Verhalten und Revier: Die Größe der Reviere hängt vom Geschlecht (männliche Tiere besitzen größere Reviere), der sexuellen Aktivität (während der Fortpflanzungszeit ist dieses größer) und von der Populationsdichte (bei hohen Dichten sind die Reviere kleiner) ab. Überlappungen der Reviere werden nur außerhalb der Fortpflanzungszeit bei einer hohen Anzahl von Individuen beobachtet.Zur Paarungszeit besitzt ein geschlechtsreifes Männchen ein Revier von rund 1434 ± 910 m² (SD), welches aggressiv gegenüber Artgenossen verteidigt wird. Kämpfe werden durch ruckartiges Umherlaufen, Haarsträuben, Zähnewetzen und Beißen begleitet. Bei gleich starken Tieren kommt es zu Boxkämpen. In der Regel unterwirft sich danach das unterlegene Männchen, indem es sich auf den Rücken legt. Außerhalb der Fortpflanzungszeit ist das Revier mit 600 ± 447 m² (SD) jedoch kleiner und auch die innerartliche Aggressivität im restlichen Jahr ist geringer. Weibliche Tiere besitzen kleinere Reviere von 480 ± 357 m² (SD) bzw. zur Paarungszeit 773 ± 547 m² (SD). Während sie Junge säugen ist dieses mit 67 m² am kleinsten. Die Abwanderung der Tiere ist gering und betrifft fast ausschließlich Männchen, welche doppelt so große Distanzen (60 m) wie Weibchen zurücklegen. Während adulte Erdmäuse selten (3 %) abwandern, ist dies bei Jungtieren häufiger zu beobachten und nur 20 % der Tiere erreichen die Geschlechtsreife an ihrem Geburtsort.

Kommunikation und Orientierung: Der Geruchsinn ist für die Erdmaus zur innerartliche Verständigung und zur Feinderkennung sehr wichtig. So dient der intensive moschusartige Geruch der Männchen sehr wahrscheinlich der Geschlechterfindung und territorialen Abgrenzung. Vokale Kommunikation ist meist auffallend, so werden Begegnungen zweier Tiere häufig durch ein Rattern begleitet. Angst- und Drohrufe können als „tucktucktuck…“ ebenfalls gehört werden.

Bau: Die Erdmaus legt ihr Gangsystem je nach Bodenfeuchte teilweise unterirdisch oder bei nassen Standorten fast ausschließlich oberirdisch an. An trockenen Standorten befinden sich Gänge, Kammern und Kotablageplätze dicht an der Oberfläche oder zum Teil in der verfilzten Krautschicht. An sehr nassen Standorten baut die Erdmaus oberirdische Grasnester in Seggenbulten oder in Wurzelnischen von Gehölzen.

Die Fortpflanzung findet von März bis Oktober statt, wobei die Hauptpaarungszeit im Mai-August liegt. Nach einer Tragzeit von 20–21 Tagen gebären sie in Abhängigkeit von Jahreszeit und Alter zwischen 3–8 Jungtiere, welche nach 2 Wochen selbstständig sind und von der Mutter vertrieben werden. Da eine erneute Begattung unmittelbar nach der Geburt stattfinden kann, betragen die Wurfintervalle nur 3 Wochen. Im Sommer werden von diesjährigen Weibchen bis zu 4 Generationen geboren. In milden Wintern kann es zudem zu vereinzelten Winterwürfen kommen, welche jedoch nur eine geringe Jungenzahl aufweisen. Über das Sozialverhalten der Erdmaus ist nur wenig bekannt. Es wurden verschiedene Systeme der Sozialorganisation wie Monogamie, Polygamie oder Promiskuität beobachtet. Dass sich, wie bei der Feldmaus, Weibchenverbände bilden, gilt jedoch als unwahrscheinlich.
Erdmäuse sind für ihre hohen Populationsdichten, welche in Ausnahmefällen bis zu 300 Individuen pro Hektar erreichen, bekannt. Diese sind jedoch meist nur von kurzer Dauer und nehmen vor allem durch Nahrungsknappheit, innerartlichen Stress, der Zunahme von Parasiten und Krankheiten sowie durch Beutegreifer wieder auf natürliche Weise ab. Das Auftreten von Zyklen ist innerhalb ihres Verbreitungsgebietes sehr variabel, da ökologische Präferenzen und Geburtenraten je nach Standort verschieden sind. So können zum Beispiel hohe Dichten in Feuchtgebieten durch fehlende Ausbreitungsmöglichkeiten entstehen. Bei nicht-zyklischen Populationen werden Qualität und Quantität der Nahrungsquellen als entscheidende Faktoren für das Ausbleiben von Dichteschwankungen verantwortlich gemacht.

Die Nahrung der Erdmaus ist rein pflanzlich und besteht aus grünen Teilen von Pflanzen, Setzlingen und Samen. Nur bei Nahrungsmangel nagt sie auch an Wurzeln und Rinden von jungen Nadel- und Laubbäumen (vorwiegend Buche, Eiche, Esche und Ahorn), wobei der Verzehr durch Mineralstoffmangel induziert wird. Die Zähne dringen horizontal in das Holz ein und hinterlassen charakteristische Abdrücke mit einer Breite von 0,7 – 1 mm. Da sie nicht gut klettern kann, ist dieses „Ringeln“, im Gegensatz zur Rötelmaus (Myodes glareolus), nur am unteren Teil des Baumstamms zu beobachten.

Erd- und Feldmaus leben häufig in unmittelbarer Nachbarschaft, da die Feldmaus jedoch trockene Böden bevorzugt, kommt es fast sie zu einer direkten Konkurrenz. Tritt diese dennoch ein, wird die Erdmaus meist in ungünstigere Habitate verdrängt.  Als Fressfeinde der Erdmaus gelten besonders der Waldkauz (Strix aluco), der Raufußkauz (Aegolius funereus), die Schleiereule (Tyto alba) und die Waldohreule (Asio otus). Unter den Säugetieren wird sie häufig von Fuchs (Vulpes vulpes), Hermelin (Mustela erminea), Mauswiesel  (M. nivalis) und verschiedene Marder (Martes) erbeutet.

Erdmäuse gelten als nicht gefährdet. Konflikte ergeben sich in Lebensräumen mit menschlicher Nutzung. Denn folgt nach einer Massenvermehrung Nahrungsknappheit, fressen die Tiere während der Wintermonate Wurzeln und Rinde junger Bäume. Anstelle von Schlagfallen und Giften kommen heute vermehrt vorbeugende Maßnahmen, wie die Errichtung von Ansitzwarten für Greifvögel zum Einsatz.

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